早晨是安全教育,一个教授对着我们三个中国人讲了一早晨,从不小心把THF倒在地上如何解决一直讲到发生热核打击。美国人对于人生安全还真是重视啊……估计是因为医疗费用很贵。
回去以后就到网站上开始做题,从HIV一直做到核弹,做了三遍才全部及格。
昨天算的东西还是收敛失败。以前用Gaussian的时候,对于这个问题我一般拿着初始构象一阵乱扭再拿去优化就没问题了,但是对于蛋白质的结构来说,初始结构肯定是从PDB中获得的。而且对于B3LYP这个方法,总体来说我对它爱恨交加,好处是Beck和L,Y,P三人运气好,消灭了DFT的一些通病,坏处是,DFT的其他臭毛病还在,比如经常不收敛等等。
Gamess和Gaussian相比,有一个好处就是输出很详细,比如使用DFT或者MP2计算时,HF部分的能量和密度泛函或者微扰的能量是分别计算的,看得很清楚。当然我以后也不可能用Gaussian了,因为进了这个组就算Banned by Gaussian了。
下午一直在算东西看文献,无甚新意。